この陰鬱なリブートの要となるのは、失墜し、中毒に陥った科学者として描かれるリード・リチャーズ自身です。ニューヨーク工科大学（NYIT）を解雇されたリードは、危険な薬物中毒に駆られ、その薬物が彼の知覚を変えているかのように見えながら、ネガティブゾーンへのゲートウェイに関する違法な実験を続けています。悲劇が起こるのは、これらの秘密裏のセッションの一つで、彼の研究助手である若く、当初は熱心だったヴィクター・フォン・ドゥームが、リードの過失により恐ろしい火傷を負います。リードの即座の反応は、懸念を示す代わりに、ヴィクターが向こう側で何を見たかを尋ねることであり、ドゥームは「地獄だ」とぞっとするような返事をします。

この出来事が、ドクター・ドゥームの根本的に変更されたオリジンを決定づけます。ヴィクターはラトベリアに連れて行かれ、そこで鉄仮面をつけた謎めいた母親が、リードの仕事について彼を尋問します。シリーズは、ヴィクターの母親がこのユニバースの真のドクター・ドゥームであるか、少なくともネガティブゾーンについて深い知識を持つ強力な人物である可能性を示唆する、深遠なひねりを暗示しています。この再文脈化は、ドゥームの傷に対する責任をリードに明確に転嫁し、ヴィクターの傲慢さが原因であったオリジナルの伝承とは大きく異なります。

さらなる陰謀の層を加えるのは、Storm Systemsのオーナーであるスーザン・ストームです。従来のインビジブル・ウーマンとはかけ離れたこのバージョンのスーは、自身の影のある目的を持つ操り人形師のように見えます。彼女はドゥームの事故後、リードを刑務所から保釈し、彼が彼女のために働くことを条件にNYITに賄賂を渡し、告訴を取り下げさせます。彼女の動機は、歴史的なマンハッタン計画の場所でのロケット実験を明らかにしたときに、さらに不穏なものになります。そこでは、核のキノコ雲の写真の中に、不気味なクトゥルフのような存在が写っています。この恐ろしい発見にもかかわらず、スーはリードにネガティブゾーンのゲートウェイを開くよう主張し、彼女の真の意図と、彼女がどのような宇宙的恐怖を知っているのか、あるいは画策しているのかについて疑問を投げかけます。

物語が展開するにつれて、より大きく、より不吉な脅威が迫ってきます。ネガティブゾーンの壁の向こうにギャラクタスがいるという噂がある一方で、リードの薬物による幻覚は、別の謎めいた要素「ライトキーパーズ」を紹介します。彼らはリードの禁断症状中に彼に誓いを唱えます。これらの存在はギャラクタスのヘラルドである可能性もあれば、あるいは全く異なる何か、例えばインヒューマンズやウォッチャーズのような宇宙的存在からの警告である可能性もあります。迫りくる悪の全体的な謎と、道徳的に堕落したヒーローたちが組み合わさることで、『*Midnight Fantastic Four*』はMarvelの新しい、よりダークなユニバースにおける傑出した作品として確立され、読者にスリリングで不穏な旅を約束します。